Jag har kopplat ihop alla möjliga grejer på både 6, 12 och 24v men aldrig kopplat som du har tänkt...
Jorden blir inget problem för båda batterierna ska jordas i karossen (inget måste för fritidsbatteriet men det underlättar din koppling...).
Jag kan inte tänka mig att det blir några problem att du har startbatteriet kopplat på gul kabel och fritidsbatteriet på röd kabel, en liten skillnad i volt kan det såklart bli men har svårt att tänka mig att det ska va några problem.
Jag hade köpt en liten strömbrytare där du kan koppla in stereon och sen switcha mellan batterierna (har tyvärr inte tid att googla fram någon nu...). Så borde det funka som du har tänkt dig.