Det viktiga är inte att du får ett borr som stämmer överrens exakt med "innerdiametern" eller vad man ska kalla det på skruven, utan att det är samma eller mindre än den (ifall att du inte har ett borr i rätt storlek)
Angående djupet så ja, förborra så djupt som skruven kommer gå, ta och sätt i borret i skruvmaskinen, sen tar du bara och lägger skruven emot och sätter en liten tejpremsa där skruven slutar så får du rätt djup på alla hålen 
Ett till tips är att ta och borra hålen i sidoplattorna först, sedan tar du och sätter ihop lådan utan skruv eller lim och så tar du en dyckert och i hålen du borrat och bara slår till lite lätt så får du en markering vart du ska borra i den stående skivan, betydligt mkt lättare än att försöka borra allt på samma gång
Simple and clean, all you ever need to know ;)
